Mikrobioomika

Liikmed

Uurimisrühma juht

Publikatsioonid

Väljaanne: Metabolism
Autorid: Beghini, Marianna; Metz, Matthäus; Baumgartner, Clemens; Wolf, Peter; Bastian, Magdalena; Hackl, Martina; Baumgartner-Parzer, Sabina; Marculescu, Rodrig; Krebs, Michael; Harreiter, Jürgen; Brandt, Stephanie; Miehle, Konstanze; Ceccarini, Giovanni; Magno, Silvia; Pelosini, Caterina; Tran, Christel; Gambineri, Alessandra; Cecchetti, Carolina; Gard, Liliana-Imi; Risti, Robert ... Scherer, Thomas
Aasta: 2025
Väljaanne: Communications Biology
Autorid: Abner, Kristo; Šverns, Peter; Arold, Janar; Lints, Taivo; Eller, Neeme-Andreas; Morell, Indrek; Seiman, Andrus; Adamberg, Kaarel; Vilu, Raivo
Aasta: 2025
Väljaanne: Nature Communications
Autorid: Mao, Xiaotian; Larsen, Sabina Birgitte; Zachariassen, Line Sidsel Fisker; Brunse, Anders; Adamberg, Signe; Mejia, Josue Leonardo Castro; Larsen, Frej; Adamberg, Kaarel; Nielsen, Dennis Sandris; Hansen, Axel Kornerup; Hansen, Camilla Hartmann Friis; Rasmussen, Torben Sølbeck
Aasta: 2024

Projektid

Aasta: 2024 - 2028
Heaoluühiskonnas on kiudainete tarbimine oluliselt madalam toitumissoovitustes toodust, mis häirib soolemikrobioota tasakaalu ning vähendab kasulike bakteriaalsete ühendite teket seedetraktis. Bakterid toodavad ka gaase, mis tundlikel inimestel, sealhulgas ärritunud soole sündroomi (IBS) patsientidel, põhjustavad häirivaid ja ka töötamist takistavaid seedetrakti sümptomeid, mille tulemusel välditakse kiudainerikkaid toite. Gaasi moodustumise hulk ja mustrid on väga individuaalsed ja omavahel seotud soolestiku parameetritega nagu pH ja soole läbikäigukiirus. FIBRE-MATCH projektis töötatakse välja ja valideeritakse tehnoloogia, mis võimaldab sobitada soolemikrobioomi alatüübid kiudainete tüüpidega optimaalseks bakteriaalsete ühendite, sh gaaside moodustumiseks. Projektis kaardistatakse peamised eurooplastel levinud kiudaineid lagundavad mikrobioomitüübid, kasutades kaasaegseid oomikameetodeid, tervise- ja toitumisandmeid ja bakterite andmebaaside andmeid. Ainevahetuse fenotüüpide tuvastamiseks kasutatakse ka laborimeetodeid optimaalse gaasi ja hapete suhete leidmiseks. Nende põhjal töötatakse välja kiudainerikaste fermenteeritud toitude prototüübid, mille mõju inimese tervisele, mikrobioomi muutustele ja hapete ning gaasi tootmisele uuritakse nii tervetel kui ka IBS patsientidel toitumisuuringutes. Projektis töötatakse välja uudne kiudainete keemilise koostise andmebaas toiduainetes, et võimaldada toitumise ja mikrobioomi koostoimete analüüsi funktsionaalsel ja molekulaarsel tasandil. Projekti koduleht: fibrematch.eu
Aasta: 2021 - 2025
Eesmärgiks on kaardistada inimeste fermenteeritud toitude tarbimisharjumused 34 Euroopa riigis.

Tunnustused

Tänukiri 2014. a. Eesti üliõpilaste teadustööde riiklikul konkursil peapreemia pälvinud Kaspar Valgepea doktoritöö juhendamise eest
2014
Tallinna Tehnikaülikooli parim noorteadlane
2012
Eesti üliõpilaste teadustööde riiklikul konkursil loodusteaduste ja tehnika valdkonna magistriõppe üliõpilaste astmes II preemia (jagatud) magistritöö eest.
2006